El Instituto Manuel Dorrego fue fundado en el año 1994, en el predio que fuera la casa de su fundador y familia, el Lic. Marcelo Cabrera. Su primera directora fue la docente Alicia Ortega, ex-inspectora de educación y de reconocida trayectoria en instituciones educativas del distrito.
La escuela abrió sus puertas en el ciclo lectivo 1994 con dos secciones del nivel inicial en el turno tarde, y 1er grado en el turno mañana.